bioconductor.org

Bioconductor is an open source and open development software project
for the analysis and comprehension of genomic data.

Lab1.R

################################################### ### chunk number 1: loadlibs ###################################################

library(Biobase) library(annotate) library(golubEsets)

################################################### ### chunk number 2: lookatesets ###################################################

data(golubTrain)

golubTrain

golubTrain[,1:10]

golubTrain[1:100,]

################################################### ### chunk number 3: phenodata ###################################################

pD <- phenoData(golubTrain)

pd <- pData(pD)

################################################### ### chunk number 4: phenodata2 ###################################################

table(pD$ALL.AML)

##different data data(golubTest) table(golubTest$ALL.AML)

2009-10-26

BioC 2.5, consisting of 352 packages and designed to work with R 2.10.z, was released today.

2009-01-07

R, the open source platform used by Bioconductor, featured in a series of articles in the New York Times.