| Back to Multiple platform build/check report for BioC 3.21: simplified long |
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| Hostname | OS | Arch (*) | R version | Installed pkgs |
|---|---|---|---|---|
| nebbiolo1 | Linux (Ubuntu 24.04.1 LTS) | x86_64 | R Under development (unstable) (2025-03-13 r87965) -- "Unsuffered Consequences" | 4787 |
| palomino7 | Windows Server 2022 Datacenter | x64 | R Under development (unstable) (2025-03-01 r87860 ucrt) -- "Unsuffered Consequences" | 4557 |
| lconway | macOS 12.7.1 Monterey | x86_64 | R Under development (unstable) (2025-03-02 r87868) -- "Unsuffered Consequences" | 4586 |
| kjohnson3 | macOS 13.7.1 Ventura | arm64 | R Under development (unstable) (2025-03-02 r87868) -- "Unsuffered Consequences" | 4538 |
| kunpeng2 | Linux (openEuler 24.03 LTS) | aarch64 | R Under development (unstable) (2025-02-19 r87757) -- "Unsuffered Consequences" | 4523 |
| Click on any hostname to see more info about the system (e.g. compilers) (*) as reported by 'uname -p', except on Windows and Mac OS X | ||||
| Package 1345/2316 | Hostname | OS / Arch | INSTALL | BUILD | CHECK | BUILD BIN | ||||||||
| MsBackendMetaboLights 1.1.4 (landing page) Johannes Rainer
| nebbiolo1 | Linux (Ubuntu 24.04.1 LTS) / x86_64 | OK | OK | OK |  | ||||||||
| palomino7 | Windows Server 2022 Datacenter / x64 | OK | OK | OK | OK | | ||||||||
| lconway | macOS 12.7.1 Monterey / x86_64 | OK | OK | OK | OK | | ||||||||
| kjohnson3 | macOS 13.7.1 Ventura / arm64 | OK | OK | OK | OK | | ||||||||
| kunpeng2 | Linux (openEuler 24.03 LTS) / aarch64 | OK | OK | OK | ||||||||||
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To the developers/maintainers of the MsBackendMetaboLights package: - Allow up to 24 hours (and sometimes 48 hours) for your latest push to git@git.bioconductor.org:packages/MsBackendMetaboLights.git to reflect on this report. See Troubleshooting Build Report for more information. - Use the following Renviron settings to reproduce errors and warnings. - If 'R CMD check' started to fail recently on the Linux builder(s) over a missing dependency, add the missing dependency to 'Suggests:' in your DESCRIPTION file. See Renviron.bioc for more information. |
| Package: MsBackendMetaboLights |
| Version: 1.1.4 |
| Command: /home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/bin/R CMD check --install=check:MsBackendMetaboLights.install-out.txt --library=/home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/site-library --timings MsBackendMetaboLights_1.1.4.tar.gz |
| StartedAt: 2025-04-01 00:17:28 -0400 (Tue, 01 Apr 2025) |
| EndedAt: 2025-04-01 00:27:44 -0400 (Tue, 01 Apr 2025) |
| EllapsedTime: 615.9 seconds |
| RetCode: 0 |
| Status: OK |
| CheckDir: MsBackendMetaboLights.Rcheck |
| Warnings: 0 |
##############################################################################
##############################################################################
###
### Running command:
###
### /home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/bin/R CMD check --install=check:MsBackendMetaboLights.install-out.txt --library=/home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/site-library --timings MsBackendMetaboLights_1.1.4.tar.gz
###
##############################################################################
##############################################################################
* using log directory ‘/home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/meat/MsBackendMetaboLights.Rcheck’
* using R Under development (unstable) (2025-03-13 r87965)
* using platform: x86_64-pc-linux-gnu
* R was compiled by
gcc (Ubuntu 13.3.0-6ubuntu2~24.04) 13.3.0
GNU Fortran (Ubuntu 13.3.0-6ubuntu2~24.04) 13.3.0
* running under: Ubuntu 24.04.2 LTS
* using session charset: UTF-8
* checking for file ‘MsBackendMetaboLights/DESCRIPTION’ ... OK
* this is package ‘MsBackendMetaboLights’ version ‘1.1.4’
* package encoding: UTF-8
* checking package namespace information ... OK
* checking package dependencies ... OK
* checking if this is a source package ... OK
* checking if there is a namespace ... OK
* checking for hidden files and directories ... OK
* checking for portable file names ... OK
* checking for sufficient/correct file permissions ... OK
* checking whether package ‘MsBackendMetaboLights’ can be installed ... OK
* checking installed package size ... OK
* checking package directory ... OK
* checking ‘build’ directory ... OK
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* checking top-level files ... OK
* checking for left-over files ... OK
* checking index information ... OK
* checking package subdirectories ... OK
* checking code files for non-ASCII characters ... OK
* checking R files for syntax errors ... OK
* checking whether the package can be loaded ... OK
* checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK
* checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
* checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK
* checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK
* checking loading without being on the library search path ... OK
* checking dependencies in R code ... OK
* checking S3 generic/method consistency ... OK
* checking replacement functions ... OK
* checking foreign function calls ... OK
* checking R code for possible problems ... OK
* checking Rd files ... OK
* checking Rd metadata ... OK
* checking Rd cross-references ... OK
* checking for missing documentation entries ... OK
* checking for code/documentation mismatches ... OK
* checking Rd \usage sections ... OK
* checking Rd contents ... OK
* checking for unstated dependencies in examples ... OK
* checking files in ‘vignettes’ ... OK
* checking examples ... OK
Examples with CPU (user + system) or elapsed time > 5s
user system elapsed
MsBackendMetaboLights 8.912 1.505 16.042
MetaboLights-utils 0.461 0.019 7.048
* checking for unstated dependencies in ‘tests’ ... OK
* checking tests ...
Running ‘testthat.R’
OK
* checking for unstated dependencies in vignettes ... OK
* checking package vignettes ... OK
* checking re-building of vignette outputs ... OK
* checking PDF version of manual ... OK
* DONE
Status: OK
MsBackendMetaboLights.Rcheck/00install.out
############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/bin/R CMD INSTALL MsBackendMetaboLights ### ############################################################################## ############################################################################## * installing to library ‘/home/biocbuild/bbs-3.21-bioc/R/site-library’ * installing *source* package ‘MsBackendMetaboLights’ ... ** this is package ‘MsBackendMetaboLights’ version ‘1.1.4’ ** using staged installation ** R ** byte-compile and prepare package for lazy loading ** help *** installing help indices *** copying figures ** building package indices ** installing vignettes ** testing if installed package can be loaded from temporary location ** testing if installed package can be loaded from final location ** testing if installed package keeps a record of temporary installation path * DONE (MsBackendMetaboLights)
MsBackendMetaboLights.Rcheck/tests/testthat.Rout
R Under development (unstable) (2025-03-13 r87965) -- "Unsuffered Consequences"
Copyright (C) 2025 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu
R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
You are welcome to redistribute it under certain conditions.
Type 'license()' or 'licence()' for distribution details.
R is a collaborative project with many contributors.
Type 'contributors()' for more information and
'citation()' on how to cite R or R packages in publications.
Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.
> #' MetaboLights ID: MTBLS8735
> #' ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/metabolights/studies/public/MTBLS8735
>
> library(testthat)
> library(MsBackendMetaboLights)
Loading required package: Spectra
Loading required package: S4Vectors
Loading required package: stats4
Loading required package: BiocGenerics
Loading required package: generics
Attaching package: 'generics'
The following objects are masked from 'package:base':
as.difftime, as.factor, as.ordered, intersect, is.element, setdiff,
setequal, union
Attaching package: 'BiocGenerics'
The following objects are masked from 'package:stats':
IQR, mad, sd, var, xtabs
The following objects are masked from 'package:base':
Filter, Find, Map, Position, Reduce, anyDuplicated, aperm, append,
as.data.frame, basename, cbind, colnames, dirname, do.call,
duplicated, eval, evalq, get, grep, grepl, is.unsorted, lapply,
mapply, match, mget, order, paste, pmax, pmax.int, pmin, pmin.int,
rank, rbind, rownames, sapply, saveRDS, table, tapply, unique,
unsplit, which.max, which.min
Attaching package: 'S4Vectors'
The following object is masked from 'package:utils':
findMatches
The following objects are masked from 'package:base':
I, expand.grid, unname
Loading required package: BiocParallel
>
> test_check("MsBackendMetaboLights")
[ FAIL 0 | WARN 0 | SKIP 0 | PASS 74 ]
>
> ## Run tests with the unit test suite defined in the Spectra package to ensure
> ## compliance with the definitions of the MsBackend interface/class.
> be <- backendInitialize(MsBackendMetaboLights(), mtblsId = "MTBLS39",
+ filePattern = "63A.cdf")
Used data files from the assay's column "Raw Spectral Data File" since none were available in column "Derived Spectral Data File".
>
> library(Spectra)
> test_suite <- system.file("test_backends", "test_MsBackend",
+ package = "Spectra")
> res <- test_dir(test_suite, stop_on_failure = TRUE)
✔ | F W S OK | Context
⠏ | 0 | peaks_variables
⠙ | 2 | peaks_variables
⠸ | 4 | peaks_variables
✔ | 4 | peaks_variables
⠏ | 0 | spectra_subsetting
⠋ | 1 | spectra_subsetting
⠹ | 13 | spectra_subsetting
⠼ | 25 | spectra_subsetting
⠦ | 37 | spectra_subsetting
⠇ | 49 | spectra_subsetting
⠋ | 61 | spectra_subsetting
⠹ | 73 | spectra_subsetting
⠼ | 85 | spectra_subsetting
⠦ | 97 | spectra_subsetting
⠇ | 109 | spectra_subsetting
⠋ | 121 | spectra_subsetting
⠹ | 133 | spectra_subsetting
⠼ | 145 | spectra_subsetting
⠦ | 157 | spectra_subsetting
⠇ | 169 | spectra_subsetting
⠋ | 181 | spectra_subsetting
⠹ | 193 | spectra_subsetting
⠙ | 202 | spectra_subsetting
⠸ | 214 | spectra_subsetting
⠴ | 226 | spectra_subsetting
⠧ | 238 | spectra_subsetting
⠦ | 247 | spectra_subsetting
⠴ | 256 | spectra_subsetting
⠧ | 268 | spectra_subsetting
⠏ | 280 | spectra_subsetting
⠙ | 292 | spectra_subsetting
⠸ | 304 | spectra_subsetting
⠴ | 316 | spectra_subsetting
⠇ | 329 | spectra_subsetting
⠋ | 341 | spectra_subsetting
⠙ | 352 | spectra_subsetting
⠸ | 364 | spectra_subsetting
⠴ | 376 | spectra_subsetting
⠏ | 390 | spectra_subsetting
⠹ | 403 | spectra_subsetting
⠴ | 416 | spectra_subsetting
⠇ | 429 | spectra_subsetting
⠇ | 439 | spectra_subsetting
⠋ | 451 | spectra_subsetting
⠹ | 463 | spectra_subsetting
⠼ | 475 | spectra_subsetting
⠦ | 487 | spectra_subsetting
⠇ | 499 | spectra_subsetting
⠋ | 511 | spectra_subsetting
⠸ | 524 | spectra_subsetting
⠧ | 538 | spectra_subsetting
⠋ | 551 | spectra_subsetting
⠙ | 562 | spectra_subsetting
⠼ | 575 | spectra_subsetting
⠧ | 588 | spectra_subsetting
⠇ | 599 | spectra_subsetting
⠏ | 610 | spectra_subsetting
⠙ | 622 | spectra_subsetting
⠸ | 634 | spectra_subsetting
⠦ | 647 | spectra_subsetting
⠧ | 658 | spectra_subsetting
⠏ | 670 | spectra_subsetting
⠙ | 682 | spectra_subsetting
⠸ | 694 | spectra_subsetting
⠦ | 707 | spectra_subsetting
⠋ | 721 | spectra_subsetting
⠸ | 734 | spectra_subsetting
⠼ | 745 | spectra_subsetting
⠧ | 758 | spectra_subsetting
⠋ | 771 | spectra_subsetting
⠹ | 783 | spectra_subsetting
⠼ | 795 | spectra_subsetting
⠧ | 808 | spectra_subsetting
⠋ | 821 | spectra_subsetting
⠹ | 833 | spectra_subsetting
⠼ | 845 | spectra_subsetting
⠧ | 858 | spectra_subsetting
⠧ | 868 | spectra_subsetting
⠋ | 881 | spectra_subsetting
⠸ | 894 | spectra_subsetting
⠦ | 907 | spectra_subsetting
⠇ | 919 | spectra_subsetting
⠋ | 931 | spectra_subsetting
⠹ | 943 | spectra_subsetting
⠼ | 955 | spectra_subsetting
⠦ | 967 | spectra_subsetting
⠇ | 979 | spectra_subsetting
⠋ | 991 | spectra_subsetting
⠹ | 1003 | spectra_subsetting
⠼ | 1015 | spectra_subsetting
⠦ | 1027 | spectra_subsetting
⠇ | 1039 | spectra_subsetting
⠋ | 1051 | spectra_subsetting
⠹ | 1063 | spectra_subsetting
⠴ | 1076 | spectra_subsetting
⠧ | 1088 | spectra_subsetting
⠇ | 1099 | spectra_subsetting
⠋ | 1111 | spectra_subsetting
⠹ | 1123 | spectra_subsetting
⠴ | 1136 | spectra_subsetting
⠇ | 1149 | spectra_subsetting
⠏ | 1160 | spectra_subsetting
⠙ | 1172 | spectra_subsetting
⠇ | 1179 | spectra_subsetting
⠋ | 1191 | spectra_subsetting
⠙ | 1202 | spectra_subsetting
⠹ | 1213 | spectra_subsetting
⠼ | 1225 | spectra_subsetting
⠦ | 1237 | spectra_subsetting
⠇ | 1249 | spectra_subsetting
⠋ | 1261 | spectra_subsetting
⠹ | 1273 | spectra_subsetting
⠼ | 1285 | spectra_subsetting
⠦ | 1297 | spectra_subsetting
⠇ | 1309 | spectra_subsetting
⠋ | 1321 | spectra_subsetting
⠹ | 1333 | spectra_subsetting
⠼ | 1345 | spectra_subsetting
⠦ | 1357 | spectra_subsetting
⠇ | 1369 | spectra_subsetting
⠋ | 1381 | spectra_subsetting
⠹ | 1393 | spectra_subsetting
⠼ | 1405 | spectra_subsetting
⠦ | 1417 | spectra_subsetting
⠧ | 1428 | spectra_subsetting
⠧ | 1438 | spectra_subsetting
⠏ | 1450 | spectra_subsetting
⠙ | 1462 | spectra_subsetting
⠸ | 1474 | spectra_subsetting
⠴ | 1486 | spectra_subsetting
⠼ | 1495 | spectra_subsetting
⠦ | 1507 | spectra_subsetting
⠇ | 1519 | spectra_subsetting
⠋ | 1531 | spectra_subsetting
⠹ | 1543 | spectra_subsetting
⠼ | 1555 | spectra_subsetting
⠦ | 1567 | spectra_subsetting
⠇ | 1579 | spectra_subsetting
⠋ | 1591 | spectra_subsetting
⠹ | 1603 | spectra_subsetting
⠼ | 1615 | spectra_subsetting
⠦ | 1627 | spectra_subsetting
⠇ | 1639 | spectra_subsetting
⠋ | 1651 | spectra_subsetting
⠹ | 1663 | spectra_subsetting
⠼ | 1675 | spectra_subsetting
⠧ | 1688 | spectra_subsetting
⠏ | 1700 | spectra_subsetting
⠙ | 1712 | spectra_subsetting
⠸ | 1724 | spectra_subsetting
⠼ | 1735 | spectra_subsetting
⠦ | 1747 | spectra_subsetting
⠇ | 1759 | spectra_subsetting
⠋ | 1771 | spectra_subsetting
⠹ | 1783 | spectra_subsetting
⠼ | 1795 | spectra_subsetting
⠦ | 1807 | spectra_subsetting
⠇ | 1819 | spectra_subsetting
⠋ | 1831 | spectra_subsetting
⠹ | 1843 | spectra_subsetting
⠼ | 1855 | spectra_subsetting
⠦ | 1867 | spectra_subsetting
⠇ | 1879 | spectra_subsetting
⠋ | 1891 | spectra_subsetting
⠹ | 1903 | spectra_subsetting
⠼ | 1915 | spectra_subsetting
⠴ | 1926 | spectra_subsetting
⠴ | 1936 | spectra_subsetting
⠧ | 1948 | spectra_subsetting
⠏ | 1960 | spectra_subsetting
⠙ | 1972 | spectra_subsetting
⠸ | 1984 | spectra_subsetting
⠦ | 1997 | spectra_subsetting
⠇ | 2009 | spectra_subsetting
⠋ | 2021 | spectra_subsetting
⠹ | 2033 | spectra_subsetting
⠸ | 2044 | spectra_subsetting
⠴ | 2056 | spectra_subsetting
⠧ | 2068 | spectra_subsetting
⠏ | 2080 | spectra_subsetting
⠙ | 2092 | spectra_subsetting
⠸ | 2104 | spectra_subsetting
⠴ | 2116 | spectra_subsetting
⠦ | 2127 | spectra_subsetting
⠦ | 2137 | spectra_subsetting
⠇ | 2149 | spectra_subsetting
⠋ | 2161 | spectra_subsetting
⠹ | 2173 | spectra_subsetting
⠼ | 2185 | spectra_subsetting
⠦ | 2197 | spectra_subsetting
⠇ | 2209 | spectra_subsetting
⠋ | 2221 | spectra_subsetting
⠹ | 2233 | spectra_subsetting
⠼ | 2245 | spectra_subsetting
⠦ | 2257 | spectra_subsetting
⠇ | 2269 | spectra_subsetting
⠋ | 2281 | spectra_subsetting
⠙ | 2292 | spectra_subsetting
⠙ | 2302 | spectra_subsetting
⠸ | 2314 | spectra_subsetting
⠴ | 2326 | spectra_subsetting
⠧ | 2338 | spectra_subsetting
⠏ | 2350 | spectra_subsetting
⠙ | 2362 | spectra_subsetting
⠸ | 2374 | spectra_subsetting
⠴ | 2386 | spectra_subsetting
⠧ | 2398 | spectra_subsetting
⠇ | 2409 | spectra_subsetting
⠏ | 2420 | spectra_subsetting
⠋ | 2431 | spectra_subsetting
⠹ | 2443 | spectra_subsetting
⠼ | 2455 | spectra_subsetting
⠦ | 2467 | spectra_subsetting
⠇ | 2479 | spectra_subsetting
⠋ | 2491 | spectra_subsetting
⠹ | 2503 | spectra_subsetting
⠼ | 2515 | spectra_subsetting
⠦ | 2527 | spectra_subsetting
⠧ | 2538 | spectra_subsetting
⠧ | 2548 | spectra_subsetting
⠏ | 2560 | spectra_subsetting
⠙ | 2572 | spectra_subsetting
⠸ | 2584 | spectra_subsetting
⠴ | 2596 | spectra_subsetting
⠧ | 2608 | spectra_subsetting
⠏ | 2620 | spectra_subsetting
⠙ | 2632 | spectra_subsetting
⠸ | 2644 | spectra_subsetting
⠴ | 2656 | spectra_subsetting
⠧ | 2668 | spectra_subsetting
⠏ | 2680 | spectra_subsetting
⠙ | 2692 | spectra_subsetting
⠸ | 2704 | spectra_subsetting
⠴ | 2716 | spectra_subsetting
⠧ | 2728 | spectra_subsetting
⠏ | 2740 | spectra_subsetting
⠙ | 2752 | spectra_subsetting
⠸ | 2764 | spectra_subsetting
⠴ | 2776 | spectra_subsetting
⠧ | 2788 | spectra_subsetting
⠏ | 2800 | spectra_subsetting
⠙ | 2812 | spectra_subsetting
⠸ | 2824 | spectra_subsetting
⠴ | 2836 | spectra_subsetting
⠧ | 2848 | spectra_subsetting
⠏ | 2860 | spectra_subsetting
⠙ | 2872 | spectra_subsetting
⠸ | 2884 | spectra_subsetting
⠴ | 2896 | spectra_subsetting
⠧ | 2908 | spectra_subsetting
⠏ | 2920 | spectra_subsetting
⠙ | 2932 | spectra_subsetting
⠸ | 2944 | spectra_subsetting
⠴ | 2956 | spectra_subsetting
⠧ | 2968 | spectra_subsetting
⠏ | 2980 | spectra_subsetting
⠙ | 2992 | spectra_subsetting
⠸ | 3004 | spectra_subsetting
⠴ | 3016 | spectra_subsetting
⠧ | 3028 | spectra_subsetting
⠏ | 3040 | spectra_subsetting
⠙ | 3052 | spectra_subsetting
⠸ | 3064 | spectra_subsetting
⠴ | 3076 | spectra_subsetting
⠧ | 3088 | spectra_subsetting
⠏ | 3100 | spectra_subsetting
⠙ | 3112 | spectra_subsetting
⠸ | 3124 | spectra_subsetting
⠴ | 3136 | spectra_subsetting
⠴ | 3146 | spectra_subsetting
⠦ | 3157 | spectra_subsetting
⠇ | 3169 | spectra_subsetting
⠋ | 3181 | spectra_subsetting
⠹ | 3193 | spectra_subsetting
⠼ | 3205 | spectra_subsetting
⠦ | 3217 | spectra_subsetting
⠇ | 3229 | spectra_subsetting
⠋ | 3241 | spectra_subsetting
⠹ | 3253 | spectra_subsetting
⠼ | 3265 | spectra_subsetting
⠦ | 3277 | spectra_subsetting
⠇ | 3289 | spectra_subsetting
⠋ | 3301 | spectra_subsetting
⠹ | 3313 | spectra_subsetting
⠼ | 3325 | spectra_subsetting
⠦ | 3337 | spectra_subsetting
⠇ | 3349 | spectra_subsetting
⠋ | 3361 | spectra_subsetting
⠹ | 3373 | spectra_subsetting
⠼ | 3385 | spectra_subsetting
⠸ | 3394 | spectra_subsetting
⠴ | 3406 | spectra_subsetting
⠧ | 3418 | spectra_subsetting
⠏ | 3430 | spectra_subsetting
⠙ | 3442 | spectra_subsetting
⠸ | 3454 | spectra_subsetting
⠴ | 3466 | spectra_subsetting
⠧ | 3478 | spectra_subsetting
⠏ | 3490 | spectra_subsetting
⠙ | 3502 | spectra_subsetting
⠸ | 3514 | spectra_subsetting
⠴ | 3526 | spectra_subsetting
⠧ | 3538 | spectra_subsetting
⠏ | 3550 | spectra_subsetting
⠙ | 3562 | spectra_subsetting
⠸ | 3574 | spectra_subsetting
⠴ | 3586 | spectra_subsetting
⠧ | 3598 | spectra_subsetting
⠏ | 3610 | spectra_subsetting
⠋ | 3621 | spectra_subsetting
⠋ | 3631 | spectra_subsetting
⠋ | 3641 | spectra_subsetting
⠙ | 3652 | spectra_subsetting
⠸ | 3664 | spectra_subsetting
⠴ | 3676 | spectra_subsetting
⠧ | 3688 | spectra_subsetting
⠏ | 3700 | spectra_subsetting
⠙ | 3712 | spectra_subsetting
⠸ | 3724 | spectra_subsetting
⠴ | 3736 | spectra_subsetting
⠧ | 3748 | spectra_subsetting
⠸ | 3754 | spectra_subsetting
⠴ | 3766 | spectra_subsetting
⠧ | 3778 | spectra_subsetting
⠏ | 3790 | spectra_subsetting
⠙ | 3802 | spectra_subsetting
⠸ | 3814 | spectra_subsetting
⠴ | 3826 | spectra_subsetting
⠧ | 3838 | spectra_subsetting
⠏ | 3850 | spectra_subsetting
⠙ | 3862 | spectra_subsetting
⠸ | 3874 | spectra_subsetting
⠴ | 3886 | spectra_subsetting
⠧ | 3898 | spectra_subsetting
⠏ | 3910 | spectra_subsetting
⠙ | 3922 | spectra_subsetting
⠸ | 3934 | spectra_subsetting
⠴ | 3946 | spectra_subsetting
⠧ | 3958 | spectra_subsetting
⠏ | 3970 | spectra_subsetting
⠙ | 3982 | spectra_subsetting
⠸ | 3994 | spectra_subsetting
⠴ | 4006 | spectra_subsetting
⠧ | 4018 | spectra_subsetting
⠏ | 4030 | spectra_subsetting
⠙ | 4042 | spectra_subsetting
⠸ | 4054 | spectra_subsetting
⠹ | 4063 | spectra_subsetting
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⠸ | 6554 | spectra_subsetting
⠼ | 6555 | spectra_subsetting
⠴ | 6556 | spectra_subsetting
⠦ | 6557 | spectra_subsetting
⠧ | 6558 | spectra_subsetting
⠇ | 6559 | spectra_subsetting
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⠋ | 6561 | spectra_subsetting
⠙ | 6562 | spectra_subsetting
⠹ | 6563 | spectra_subsetting
⠸ | 6564 | spectra_subsetting
⠼ | 6565 | spectra_subsetting
⠴ | 6566 | spectra_subsetting
⠦ | 6567 | spectra_subsetting
⠧ | 6568 | spectra_subsetting
⠇ | 6569 | spectra_subsetting
⠏ | 6570 | spectra_subsetting
⠋ | 6571 | spectra_subsetting
⠙ | 6572 | spectra_subsetting
⠹ | 6573 | spectra_subsetting
⠸ | 6574 | spectra_subsetting
⠼ | 6575 | spectra_subsetting
⠴ | 6576 | spectra_subsetting
⠦ | 6577 | spectra_subsetting
⠧ | 6578 | spectra_subsetting
⠇ | 6579 | spectra_subsetting
⠏ | 6580 | spectra_subsetting
⠋ | 6581 | spectra_subsetting
⠙ | 6582 | spectra_subsetting
⠹ | 6583 | spectra_subsetting
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⠼ | 6585 | spectra_subsetting
⠴ | 6586 | spectra_subsetting
⠦ | 6587 | spectra_subsetting
⠧ | 6588 | spectra_subsetting
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⠏ | 6590 | spectra_subsetting
⠋ | 6591 | spectra_subsetting
⠙ | 6592 | spectra_subsetting
⠹ | 6593 | spectra_subsetting
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⠴ | 6596 | spectra_subsetting
⠦ | 6597 | spectra_subsetting
⠧ | 6598 | spectra_subsetting
⠇ | 6599 | spectra_subsetting
⠏ | 6600 | spectra_subsetting
⠋ | 6601 | spectra_subsetting
⠙ | 6602 | spectra_subsetting
⠹ | 6603 | spectra_subsetting
⠸ | 6604 | spectra_subsetting
⠼ | 6605 | spectra_subsetting
⠴ | 6606 | spectra_subsetting
⠦ | 6607 | spectra_subsetting
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⠏ | 6610 | spectra_subsetting
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⠏ | 6650 | spectra_subsetting
⠋ | 6651 | spectra_subsetting
⠙ | 6652 | spectra_subsetting
⠹ | 6653 | spectra_subsetting
⠸ | 6654 | spectra_subsetting
⠼ | 6655 | spectra_subsetting
⠴ | 6656 | spectra_subsetting
⠦ | 6657 | spectra_subsetting
⠧ | 6658 | spectra_subsetting
⠇ | 6659 | spectra_subsetting
⠏ | 6660 | spectra_subsetting
⠹ | 6663 | spectra_subsetting
⠼ | 6665 | spectra_subsetting
⠹ | 6673 | spectra_subsetting
⠇ | 6679 | spectra_subsetting
⠦ | 6687 | spectra_subsetting
⠸ | 6694 | spectra_subsetting
✔ | 6702 | spectra_subsetting [307.2s]
⠏ | 0 | spectra_variables
⠙ | 12 | spectra_variables
⠸ | 14 | spectra_variables
⠴ | 16 | spectra_variables
⠦ | 27 | spectra_variables
⠇ | 29 | spectra_variables
⠋ | 31 | spectra_variables
⠹ | 43 | spectra_variables
⠸ | 54 | spectra_variables
✔ | 1 62 | spectra_variables [4.5s]
══ Results ═════════════════════════════════════════════════════════════════════
Duration: 312.5 s
── Skipped tests (1) ───────────────────────────────────────────────────────────
• empty test (1): 'test_spectra_variables.R:262:1'
[ FAIL 0 | WARN 0 | SKIP 1 | PASS 6768 ]
>
> proc.time()
user system elapsed
316.240 16.322 479.855
MsBackendMetaboLights.Rcheck/MsBackendMetaboLights-Ex.timings
| name | user | system | elapsed | |
| MetaboLights-utils | 0.461 | 0.019 | 7.048 | |
| MsBackendMetaboLights | 8.912 | 1.505 | 16.042 | |