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### Running command:
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### /home/biocbuild/bbs-3.1-bioc/R/bin/R CMD INSTALL hopach
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* installing to library ‘/home/biocbuild/bbs-3.1-bioc/R/library’
* installing *source* package ‘hopach’ ...
** libs
gcc -std=gnu99 -I/home/biocbuild/bbs-3.1-bioc/R/include -DNDEBUG -I/usr/local/include -fpic -g -O2 -Wall -c Rdistances.c -o Rdistances.o
gcc -std=gnu99 -I/home/biocbuild/bbs-3.1-bioc/R/include -DNDEBUG -I/usr/local/include -fpic -g -O2 -Wall -c hdist.c -o hdist.o
gcc -std=gnu99 -shared -L/home/biocbuild/bbs-3.1-bioc/R/lib -L/usr/local/lib -o hopach.so Rdistances.o hdist.o -L/home/biocbuild/bbs-3.1-bioc/R/lib -lR
installing to /home/biocbuild/bbs-3.1-bioc/R/library/hopach/libs
** R
** data
** inst
** preparing package for lazy loading
Creating a generic function from function ‘as.hdist’ in package ‘hopach’
Creating a generic function for ‘as.matrix’ from package ‘base’ in package ‘hopach’
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded
* DONE (hopach)