################################################### ### chunk number 1: loadLibs ################################################### #line 129 "vignettes/annotate/inst/doc/useDataPkgs.Rnw" library("annotate") library("hgu95av2.db") library("GO.db") ################################################### ### chunk number 2: getGO ################################################### #line 171 "vignettes/annotate/inst/doc/useDataPkgs.Rnw" temp <- as.list(hgu95av2GO) temp[5] ################################################### ### chunk number 3: showmget ################################################### #line 182 "vignettes/annotate/inst/doc/useDataPkgs.Rnw" mget(c("738_at", "40840_at", "41668_r_at"), hgu95av2GENENAME) ################################################### ### chunk number 4: moremget ################################################### #line 189 "vignettes/annotate/inst/doc/useDataPkgs.Rnw" temp <- mget(c("41561_s_at", "40840_at", "41668_r_at"), hgu95av2GO) ################################################### ### chunk number 5: gettingGO ################################################### #line 200 "vignettes/annotate/inst/doc/useDataPkgs.Rnw" temp <- get("738_at", hgu95av2GO) names(temp) temp[["GO:0008253"]][["Evidence"]] temp[["GO:0008253"]][["Ontology"]] ################################################### ### chunk number 6: ################################################### #line 227 "vignettes/annotate/inst/doc/useDataPkgs.Rnw" mget(names(get("738_at", hgu95av2GO)), GOTERM) ################################################### ### chunk number 7: ################################################### #line 238 "vignettes/annotate/inst/doc/useDataPkgs.Rnw" sessionInfo()