################################################### ### chunk number 1: buildCL ################################################### #line 58 "vignettes/annotate/inst/doc/chromLoc.Rnw" library("annotate") z <- buildChromLocation("hgu95av2") z ################################################### ### chunk number 2: showBasicMethods ################################################### #line 94 "vignettes/annotate/inst/doc/chromLoc.Rnw" organism(z) dataSource(z) ## The chromLocs list is extremely large. Let's only ## look at one of the elements. names(chromLocs(z)) chromLocs(z)[["Y"]] get("32972_at", probesToChrom(z)) chromInfo(z) get("32972_at", geneSymbols(z)) ################################################### ### chunk number 3: nChrom ################################################### #line 116 "vignettes/annotate/inst/doc/chromLoc.Rnw" nChrom(z)