### R code from vignette source 'vignettes/annotate/inst/doc/useDataPkgs.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: loadLibs ################################################### library("annotate") library("hgu95av2.db") library("GO.db") ################################################### ### code chunk number 2: getGO ################################################### temp <- as.list(hgu95av2GO) temp[5] ################################################### ### code chunk number 3: showmget ################################################### mget(c("738_at", "40840_at", "41668_r_at"), hgu95av2GENENAME) ################################################### ### code chunk number 4: moremget ################################################### temp <- mget(c("41561_s_at", "40840_at", "41668_r_at"), hgu95av2GO) ################################################### ### code chunk number 5: gettingGO ################################################### temp <- get("738_at", hgu95av2GO) names(temp) temp[["GO:0008253"]][["Evidence"]] temp[["GO:0008253"]][["Ontology"]] ################################################### ### code chunk number 6: useDataPkgs.Rnw:226-227 ################################################### mget(names(get("738_at", hgu95av2GO)), GOTERM) ################################################### ### code chunk number 7: useDataPkgs.Rnw:237-238 ################################################### sessionInfo()