### R code from vignette source 'DExMAdata.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: style-Sweave ################################################### BiocStyle::latex() ################################################### ### code chunk number 2: DExMAdata.Rnw:29-35 ################################################### library(DExMAdata) data(IDsDExMA) data(SynonymsDExMA) data(avaliableIDs) data(avaliableOrganism) data(DExMAExampleData) ################################################### ### code chunk number 3: DExMAdata.Rnw:44-46 ################################################### class(listMatrixEX) head(listMatrixEX$Study1) ################################################### ### code chunk number 4: DExMAdata.Rnw:50-52 ################################################### class(listPhenodatas) head(listPhenodatas$Study1) ################################################### ### code chunk number 5: DExMAdata.Rnw:59-61 ################################################### class(listExpressionSets) listExpressionSets$Study1 ################################################### ### code chunk number 6: DExMAdata.Rnw:65-67 ################################################### class(ExpressionSetStudy5) ExpressionSetStudy5 ################################################### ### code chunk number 7: DExMAdata.Rnw:75-76 ################################################### str(maObjectDif) ################################################### ### code chunk number 8: DExMAdata.Rnw:82-83 ################################################### str(maObject) ################################################### ### code chunk number 9: DExMAdata.Rnw:93-100 ################################################### class(IDsDExMA) length(IDsDExMA) names(IDsDExMA) head(IDsDExMA$Entrez) head(IDsDExMA$Genesymbol) class(SynonymsDExMA) head(SynonymsDExMA) ################################################### ### code chunk number 10: DExMAdata.Rnw:106-108 ################################################### class(SynonymsDExMA) head(SynonymsDExMA) ################################################### ### code chunk number 11: DExMAdata.Rnw:114-115 ################################################### avaliableIDs ################################################### ### code chunk number 12: DExMAdata.Rnw:120-121 ################################################### avaliableOrganism ################################################### ### code chunk number 13: DExMAdata.Rnw:142-143 ################################################### sessionInfo()