############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data maEndToEnd ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘maEndToEnd/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘maEndToEnd’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘MA-Workflow.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 224-228 [getDataEBI] (MA-Workflow.Rmd) Error: processing vignette 'MA-Workflow.Rmd' failed with diagnostics: Timeout was reached: [www.ebi.ac.uk] Resolving timed out after 10041 milliseconds --- failed re-building ‘MA-Workflow.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘MA-Workflow.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted