##############################################################################
##############################################################################
###
### Running command:
###
###   /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data CAGEWorkflow
###
##############################################################################
##############################################################################


* checking for file ‘CAGEWorkflow/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘CAGEWorkflow’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... ERROR
--- re-building ‘CAGEWorkflow.Rmd’ using rmarkdown
2024-08-20 13:15:24.029 R[82392:78307470] XType: com.apple.fonts is not accessible.
2024-08-20 13:15:24.030 R[82392:78307470] XType: XTFontStaticRegistry is enabled.

Quitting from lines 1005-1011 [kegga] (CAGEWorkflow.Rmd)
Error: processing vignette 'CAGEWorkflow.Rmd' failed with diagnostics:
cannot open the connection to 'https://rest.kegg.jp/link/pathway/mmu'
--- failed re-building ‘CAGEWorkflow.Rmd’

SUMMARY: processing the following file failed:
  ‘CAGEWorkflow.Rmd’

Error: Vignette re-building failed.
Execution halted