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### Running command:
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###   /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data methylPipe
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* checking for file ‘methylPipe/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘methylPipe’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* cleaning src
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... ERROR
--- re-building ‘methylPipe.rnw’ using knitr
Warning in in_dir(input_dir(), expr) :
  You changed the working directory to /private/tmp/Rtmpedkp1K (probably via setwd()). It will be restored to /private/tmp/RtmpwyPnZj/Rbuild174676eec59d0/methylPipe/vignettes. See the Note section in ?knitr::knit

Quitting from lines 240-245 [pmeth] (methylPipe.rnw)
Error: processing vignette 'methylPipe.rnw' failed with diagnostics:

--- failed re-building ‘methylPipe.rnw’

SUMMARY: processing the following file failed:
  ‘methylPipe.rnw’

Error: Vignette re-building failed.
Execution halted