############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data escape ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘escape/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘escape’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘vignette.Rmd’ using rmarkdown 2024-08-15 16:34:05.546 R[43950:47290534] XType: com.apple.fonts is not accessible. 2024-08-15 16:34:05.546 R[43950:47290534] XType: XTFontStaticRegistry is enabled. Quitting from lines 373-376 [unnamed-chunk-24] (vignette.Rmd) Error: processing vignette 'vignette.Rmd' failed with diagnostics: object 'compute.gene.density' not found --- failed re-building ‘vignette.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘vignette.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted