##############################################################################
##############################################################################
###
### Running command:
###
###   /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data TBSignatureProfiler
###
##############################################################################
##############################################################################


* checking for file ‘TBSignatureProfiler/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘TBSignatureProfiler’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... ERROR
--- re-building ‘tbspVignette.Rmd’ using rmarkdown

Quitting from lines 111-121 [run_profiler] (tbspVignette.Rmd)
Error: processing vignette 'tbspVignette.Rmd' failed with diagnostics:
✖ The input assay object has duplicated rownames
--- failed re-building ‘tbspVignette.Rmd’

SUMMARY: processing the following file failed:
  ‘tbspVignette.Rmd’

Error: Vignette re-building failed.
Execution halted