############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data SCArray.sat ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘SCArray.sat/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘SCArray.sat’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘SCArray.sat.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 79-101 [unnamed-chunk-2] (SCArray.sat.Rmd) Error: processing vignette 'SCArray.sat.Rmd' failed with diagnostics: object of type 'S4' is not subsettable --- failed re-building ‘SCArray.sat.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘SCArray.sat.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted