############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.20-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data --md5 MetID ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘MetID/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘MetID’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘Introduction_to_MetID.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 55-58 [unnamed-chunk-4] (Introduction_to_MetID.Rmd) Error: processing vignette 'Introduction_to_MetID.Rmd' failed with diagnostics: cannot open the connection to 'https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/cid/22833539,12544,86554,15061532,10553288,52925147/SDF' --- failed re-building ‘Introduction_to_MetID.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘Introduction_to_MetID.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted