############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data GEOquery ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘GEOquery/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘GEOquery’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘GEOquery.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 135-139 [unnamed-chunk-6] (GEOquery.Rmd) Error: processing vignette 'GEOquery.Rmd' failed with diagnostics: Timeout was reached: [ftp.ncbi.nlm.nih.gov] Connection time-out --- failed re-building ‘GEOquery.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘GEOquery.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted