############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.13-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data ToPASeq ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘ToPASeq/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘ToPASeq’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘ToPASeq.Rmd’ using rmarkdown --- finished re-building ‘ToPASeq.Rmd’ --- re-building ‘ToPASeq_allMethods.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 168-170 (ToPASeq_allMethods.Rmd) Error: processing vignette 'ToPASeq_allMethods.Rmd' failed with diagnostics: Unexpected edge type ENSEMBL Please modify edgeAttrs --- failed re-building ‘ToPASeq_allMethods.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘ToPASeq_allMethods.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted